I. Lịch sử hình thành:
Chi đoàn Bệnh viện Nhân Ái được chuyển giao từ Chi đoàn Trung tâm Trọng điểm cai nghiện ma túy thuộc Đoàn Sở Lao động - Thương bình và Xã hội sang Đoàn Sở Y tế từ ngày 18/10/2006.
Đến ngày 14/1/2008 chi đoàn Bệnh viện Nhân Ái được nâng cấp thành Đoàn cơ sở Bệnh viện Nhân Ái theo Quyết định số 01/QĐ-ĐSYT ngày 14/01/2008 trực thuộc Đoàn Sở Y tế thành phố Hồ Chí Minh. Hoạt động của Đoàn gắn liền với nhiệm vụ chính của đơn vị là chăm sóc điều trị cho bệnh nhân nhiễm HIV/AIDS giai đoạn cuối và sơ cấp cứu ban đầu cho người dân địa phương.
II.Bí thư Đoàn bệnh viện Nhân Ái qua các thời kỳ:
Đ/c Phan Thanh Vũ - Bí thư nhiệm kỳ I và II (2006-2009 & 2009-2012)
Đ/c Nguyễn Thư Tình - Bí thư nhiệm kỳ III (2012-2015)
Đ/c Nguyễn Văn Tuyên - Bí thư nhiệm kỳ IV (2015 -2017)
Đ/c Bùi Văn Tiến - Bí thư nhiệm kỳ V (2017-2022)
Đại hội đại biểu Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Đoàn cơ sở Bệnh viện Nhân Ái lần VI nhiệm kỳ (2022 – 2027) bầu ra Ban chấp hành gồm 07 đồng chí:
1. Đ/c Nròng K' Duy Py – Bí Thư
2. Đ/c Trần Thị Dung – Phó Bí Thư
3. Đ/c Nguyễn Đình Cường – Ủy viên BCH
4. Đ/c Nguyễn Hồng Hoa - Ủy viên BCH
5. Đ/c Hoàng Văn Nguyên - Ủy viên BCH
6. Đ/c Võ Thị Thu Thảo - Ủy viên BCH
7. Đ/c Nguyễn Thị Kim Tuyến - Ủy viên BCH